曾纪泽的黑旗军和兰芳国结盟以后，没了后顾之忧，他便开始和刘永福、刘阿兵等人商议驱逐婆罗洲的荷兰人。因为曾纪泽知道，很多事情要趁早，不然以后要是大英帝国干预就不好办了。
在1857年到1859年，英国海外的主要军事力量被调往镇压印度民族大起义，无暇顾及南洋地区。而这时荷兰的国内也相当混乱，而在1848年欧洲发生大动荡，1849年成为荷兰国王的威廉三世不情愿地选择托尔贝克作为新政府头脑，后者引入了数个自由主义措施，尤其是选举权的扩大。然而托尔贝克的政府不久垮台，当时新教徒为对抗梵蒂冈恢复自从16世纪就中止的天主教主教区而暴乱。而且荷兰自从十八世纪中期的“七年战争”后，就没有打一次重大的战役，它的武装力量逐渐缩荷兰把它的多数努力奉献在印尼的海外殖民地上，因为这里不需要一个庞大、强大的军队来镇压落后的土著人口。
但是曾纪泽率领黑旗军的到来，使得婆罗洲的几十万华人空前团结。曾纪泽还利用兰芳国的兵工厂，仿制了一大批当时先进的德莱赛后膛枪，装备新入伍的黑旗军。
另外，曾纪泽还以“龙腾”号为主舰，组建了黑旗军的第一支舰队，把五艘百吨重的商船改成了军舰，在甲板上安装上了重炮。
弹药补充充足之后，曾纪泽开始布兵，找借口和荷兰人开战。当时他能直接指挥的武装，达到了五千人左右。刘阿兵能调动的兰芳**队，也有四五千人。
当时荷兰的主要军事力量和控制区在爪哇岛，曾纪泽决定先从泗水和苏门答腊等外围驱赶荷兰人！
当时，刚好发生了一件让所有华人感到很愤怒的事，泗水有一个白人警察在街头打死了一个十七岁的华人小贩，然后逃跑了。
曾纪泽当即乘坐“龙腾”号，带上舰队和三千兵开进泗水港口，要求进城捉拿凶手。荷兰王国东爪哇省总督杜克别当然不同意，这严重侵犯了荷兰队印尼的主权！
“开炮！”曾纪泽果断下令，在距离荷兰的军舰“戈尔德兰”、“哈艾”两艘军舰三四海里时，他迅速挥下开炮信号旗，先发制人。
“轰隆！”
“轰隆！”
“轰隆！”
“龙腾”号战列舰上的数十门十二英镑的火炮果断开火，一发发炮弹从黑乎乎的炮口呈抛物线飞向荷兰的两艘主力军舰。荷兰的整个舰队顿时陷入一片火海，浓烟滚滚。
荷兰的海军上校马克吕布罗指挥“戈尔德兰”号全速前进，靠近了华人的军舰再开炮还击。但是“龙腾”号的速度也达到21节，速度远远大于“戈尔德兰”，曾纪泽指挥开炮，击中了“戈尔德兰”号的转向舵和前炮台，船体被炸裂成了两段，缓缓沉入了大海。“哈艾”号军舰也被重创，其他小型船只根本不堪一击，荷兰舰队大败，狼狈退回泗水港。
泗水港的要塞堡垒被“龙腾”号军舰上的重炮轰炸，足足两个小时，快到重炮高强度炮击的极限了，炮身都火热的。荷兰要塞被倾泻如雨的炸弹犹如开山剥石壁似的摧毁，一个残破损毁严重的掩体和炮台成了废墟。摆放在斜面掩体后、上方没有任何遮蔽的荷兰大炮立即都被炸毁，根本没有机会和黑旗军的炮兵对轰。
曾纪泽果断下令黑旗军登陆作战，他新训练的工兵营这时也发挥了重大作用。只见二三十个工兵在地上时而匍匐，时而跃起，几卧几起，便接近荷兰的工事，在工事薄弱处或射击口附近放置一个或大或小的爆破筒，拉动引信后迅速奔离，“轰隆”惊天巨响，火光硝烟闪动，碎木烂肉四下飞散，荷兰的军事工事土崩瓦解。
驻守泗水的荷兰军总共才五百人，被炸死炸伤大半，逃亡一批，黑旗军只用了六个小时左右的时间，就占领了全城，控制了当地的铁路交通线，把荷兰的三色旗帜扯下烧毁，升上黑旗军的旗帜，宣布正式收复了泗水城，将其中的荷兰人全部赶走，没收了他们掠夺来的全部家产！
曾纪泽和刘永福商议的作战计划是黑旗军从东、西、北三面推进到爪哇岛近接近地，控制婆罗洲，西里伯斯、苏门答腊等岛屿，从海上封锁爪哇岛接近地域，然后从东西两岸同时上陆，占领爪哇，并完成对整个荷属印度各岛的占领。
这个计划可行性很大，但不是一朝一夕的事性，需要黑旗军步步为营。
在泗水稍作休整之后，曾纪泽下令黑旗军进攻苏门答腊岛。因为苏门答腊岛自古以来山区出产黄金，16世纪时，因“金洲”之名，曾吸引不少各国探险家远赴苏门答腊寻金。一旦拿下苏门答腊，黑旗军的战争经费将大大缓解。
苏门答腊是印度尼西亚第二大岛屿，东临南海和爪哇岛，东南与爪哇岛遥接，在印尼的经济地位仅次于爪哇岛。更重要的是，此时荷兰还未完全占领苏门答腊。
占领苏门答腊岛，主要也是海战。当时荷兰有一支舰队在巨港，但是都是一些上百吨的风帆船。
那天下午，巨港港口一切正常，像多雨周末的下午一样平静，中国的舰队偷袭了巨港。大部分的时间，乌云笼罩着港口的天空，给中国去偷袭巨港的舰队提供了一道天然盾牌。荷兰人更没有想到，中国的舰队偷袭竟然不是发生在晚上，而是下午，曾纪泽颇懂孙子兵法：“出其不意，攻其不备”。
“怎么回事中国人来偷袭，他们不过春节，怎么我们一点消息都没收到？”站在“威廉”号旗舰的甲板上，荷兰舰队的指挥官卡德鲁很惊讶，他身高5英尺4英寸，脖子很粗短，远看好像脑袋下面没有过渡就直接连接了身体，他发现一艘中国的大军舰驶进港口时，已经太晚了，半个小时之内，停放在巨港西南边的7艘荷兰战舰，遭受了攻击，港口上空升起了巨大的黑烟。
“龙腾”号的一枚“撑杆雷”击中“威廉”号军舰的弹药库，随后产生的爆炸碎片四处飞溅。这种撑杆雷是用一根长杆固定在小艇艇艏，海战时小艇冲向敌舰，用撑杆雷撞击爆炸敌舰。当第一颗炸弹爆炸的时候，荷兰“阿姆斯特丹”号炮舰船长加特西和他的伙伴们，身穿他们硬挺的白色服装，衣服上佩戴着金色的编织物，一脸茫然，在他的周围，到处都在爆炸。
曾纪泽很兴奋，在“龙腾”号战舰的甲板上，挥舞着手臂，指挥炮手：“给我狠狠地轰死那些荷兰人！”
荷兰“桑那亚利”号也立即被点燃了，变成了一个大火塔，高达500英尺。接着又有3颗炮弹命中此军舰，船身发生大爆炸，迅速地开始下沉，这次大爆炸几乎震动了整个海港，在它周围几百码之外都可以感受到这股冲击波，炽热的碎片飞向船身四周。
还没等整个船体倾覆，100多名荷兰官兵就伴随着军舰葬身大海，还有一些浑身沾满污秽、疲惫不堪的荷兰海军紧贴着海面破碎的残留悬浮物，或者在满是浮油的海面上绝望地漂浮。
浓烟笼罩了整个巨港，空气里充斥着燃烧的橡胶气味和死亡的气息。铺天盖地的炮弹一起向苏门答腊上的荷兰军队袭来，在猛烈炮火的掩护下，第一批黑旗军两千人登陆，在西南海岸线进攻，占领了苏门答腊的巨港！
接着，黑旗军攻进了苏门答腊岛的南部地区，荷兰溃不成军。曾纪泽的黑旗军取得了一系列战事的胜利，在南洋声威大震！